新明倫館の設立理念は、「草莽崛起」です。この言葉は、幕末長州藩の吉田松陰が「松下村塾」を開いたときの理念で、草莽（在野にいる志のある人）よ崛起（立て！）という意味です。丸亀で起業したい、なにか市のために役に立つことをしたいという人たちが、実行するのを支援することが新明倫館の使命です。

もう一つの理念は「知行合一」です。単に知識やノウハウを学ぶだけでなく、行動しないと意味がないということです。塾で学んだことは必ず実行に移すことが大切です。